La specializzazione in Storia della Chiesa, per gli studenti che hanno completato il ciclo istituzionale di filosofia e teologia, mira a fornire la preparazione necessaria per l'insegnamento delle discipline storiche del ciclo istituzionale (Storia della Chiesa, Patrologia e Archeologia cristiana) e per rispondere alle diverse esigenze della Chiesa locale in campo storico (organizzazione degli archivi, studi sui Santi, ricerche sulla storia delle diocesi). La Specializzazione ha una durata di due anni e prevede la redazione di una tesi.
Gli studi di Teologia biblica mirano all’approfondimento della Sacra Scrittura con un approccio che mette particolarmente in rilievo il principio di unità tra Bibbia e Teologia, Antico e Nuovo Testamento, Scrittura e vita spirituale.